（もくじ）
１話　メだもん登場！ ―カビた給食のパン―【生物】
２話　知恵の実の力 ―「今」は地球が何回回ったとき？―【地学】
３話　いろはのお願い ―物の重心―【物理】
４話　ヒミツの手紙 ―あぶりだしの原理―【化学】
５話　授業中の大ピンチ！―肛門のチカラ―【生物】
６話　かさがない！ ―未来の天気を知る方法―【地学】
７話　下敷きのパワー ―静電気はなぜ起こる？―【物理】
８話　知恵の実の変化 ―黒板のイヤーな音の正体―【生物】
９話　メだもんの不安 ―消しゴムで文字が消えるヒミツ―【化学】　
10話　あたるのストレスを減らせ！ ―光の反射―【物理】
11話　ストレス解消で元どおり!? ―ちり・ほこりの正体―【地学】
12話　あたるが二人!? ―においを感じるしくみ―【化学】
13話　ダーク知恵のみVSあたる知恵の実 ―音が聞こえるしくみ―【物理】
14話　運命の２回戦!! ―筋肉のしくみ―【生物】
15話　最終決戦!! ―人工衛星が落ちない理由―【物理】